BD C6流式細胞儀由液流系統、光學與信號轉換測試系統和數字信號處理及放大的計算機系統三大基本結構組成。在對細胞懸液中的單個細胞或其超微結構進行多參數快速自動分析過程中，每秒鐘能測量數千個至數萬個細胞，能在分析過程中按實驗設計要求對特定細胞進行分析，帶細胞分選系統的流式細胞儀還可按實驗設計要求分選出具相同特征的同類型細胞，用于培養或進一步研究。
　　BD C6流式細胞儀的光學系統由激光光源、分光鏡、光束成形器、透鏡組和光電倍增管組成。
　　1.激光光源：流式細胞儀采用的多為氣冷式氬離子激光器。
　　2.分色反光鏡：作用是反射較長波長的光，通過較短波長的光。
　　3.光束成形器：由兩個十字交叉放置的圓柱形透鏡組成，作用是將激光器發射的激光束聚焦成的橢圓光斑。
　　4.透鏡組：有三個透鏡，作用是將激光和熒光變成平行光，同時除去離散的室內光。
　　5.濾片：長通濾片一允許長于設定波長的光通過；短通濾片一允許短于設定波長的光通過；帶通濾片一允許一定帶寬的波長通過，其他波長的光不能通過。
　　6.光電倍增管：由FS，SS，FLl，FL2，FL3，FIA組成，主要作用是檢測熒光和散射光，同時將光學信號轉換成電脈沖(數字數據)信號。當調整PMT電壓，脈沖信號也發生改變。