水是檢驗室內一個常常被忽視但又至關重要的試劑。在
超純水儀檢測過程中，純水作為生化反應的載體或介質、樣品或試劑的稀釋液和溶劑、儀器的清洗液甚至反應的參與者等貫穿檢測的全過程，其純度的高低直接關系到檢測結果的可信度。其中，純水質量對超純水儀及檢測結果的影響有以下幾點：
1．不合格純水中的雜質成分純水質量不合格也就意味著純水系統水純化的失敗，可能出現在原水預處理過程、三級純水的儲存和離子交換過程中的任何一步。無論哪一步失敗，其雜質來源無外乎自來水和純水機水通道的污染物，主要有：
1）電解質，常見的有H+，Na+，K+，NH4+，Mg2+，Ca2+，Fe3+，Cu2+，Mn2+，Zn2+，Al3+等陽離子和F-，CI-,N03-,HC03-,S042-,P043-,H2P04-,HSi03-等陰離子；
2）有機物質，如有機酸、農藥、烴類、醇類和酯類等；
3）顆粒物；
4）微生物；
5）溶解氣體(Nz，02，C1z，HzS，CO，COz，CH4等)；
6）其它。
2.電解質含量高對超純水儀檢測的影響
1）直接的影響就是對血清（漿）中同種離子測定結果的升高，如對Mg2+，Ca2+，Fe3+，Cu2+，Zn2+等的測定，同時也對這些項目的定標產生影響。
2）由于很多金屬離子都是酶的輔因子，因此當金屬離子含量高時往往影響酶活性的檢測（如Mg2+是多種磷酸化激酶的激活劑，水中含量超標時會導致這些酶活性測定值的升高；而許多重金屬離子則對酶有抑制作用，導致酶活性下降）。
3）很多陰離子也作為酶的輔因子存在，對酶活性測定產生影響（如CI-對a-淀粉酶就有激活作用）。
4）電解質含量高的水更容易形成結晶和導致蛋白等有機物變性附著于管道系統，從而使得超純水儀管道系統更易堵塞，終造成測定失真或失敗；同時，在使用其對反應杯進行清洗時也很難清洗干凈，會加速反應杯的老化和損壞，使杯空白升高。
3.有機物質的影響：有機物質的影響主要在于對類似物質測定時導致類似物質測定結果的升高。同時，有機物含量升高也會加速管道系統和反應杯的清洗困難及老化。
4.顆粒物的影響：顆粒物一般很難通過純水系統進入超純水儀管道和反應系統，其來源一般都是三級純水或一級純水的儲水箱發生二次污染，但是一旦進入除了會導致吸光度升高外，還很容易堵塞管道和損壞反應杯。
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